公路工程质量保证金的扣留比例通常有以下几种情况：
根据《建设工程质量保证金管理办法》第六条规定，全部或部分使用政府投资的建设项目，按工程价款结算总额的5%左右比例预留质量保证金。
《公路工程管理办法》第六条规定，公路工程质量保证金占建设工程款的3%-5%。
另外，有多个来源提到公路工程质量保证金的比例在3%-5%之间。
按照行业惯例，公路工程质量保留金通常是工程款的10%。工程竣工后，经验收合格，建设方会支付其中的5%给施工单位，其余的部分转为质量保证金。
《建设工程质量保证金管理办法》第七条规定，发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。
《公路工程管理办法》中也有类似规定，工程质量保修金不得超过施工合同价款的3%。
综合以上信息，公路工程质量保证金的扣留比例通常在3%到10%之间，具体比例应根据合同约定和工程实际情况确定。建议在签订合同时，明确约定保证金的比例和支付方式，以避免后续纠纷。