增值税发票的作废时间限制主要取决于发票的类型：
普通发票没有作废时间限制，除非在发票上加盖了有限期使用章，在该期限内必须开具和使用。
增值税专用发票在开具后的90天内必须认证，否则无法作废。如果需要作废，必须收回原发票并注明“作废”字样，或取得对方的有效证明。
对于跨月份的增值税专用发票，不能直接作废，而应按开具红字发票的程序办理。
建议
及时作废：如果发票需要作废，应尽快在规定的期限内完成作废操作，以避免后续麻烦。
认证和作废：对于增值税专用发票，务必在开具后的90天内完成认证，之后才能作废。
跨月作废：若发票已经跨月，必须通过开具红字发票的方式进行作废。
这些规定有助于确保税收管理的规范性和准确性，避免因发票作废不当而产生的税务风险。