根据中国税法，个人所得税的计算方法是 按照累进税率进行计算。具体来说，工资超过5000元的部分需要按照个人所得税的超额累进税率进行扣税。以下是具体的税率表和计算方法：
不超过36000元的部分：3%。
超过36000元至144000元的部分：10%。
超过144000元至300000元的部分：20%。
超过300000元至420000元的部分：25%。
超过420000元至660000元的部分：30%。
超过660000元至960000元的部分：35%。
超过960000元的部分：45%。
计算示例
假设某员工每月工资为31000元，五险一金为1500元，专项附加扣除为2000元，无其他扣除项。
应纳税所得额 = 月收入 - 五险一金 - 专项附加扣除 - 起征点
应纳税所得额 = 31000 - 1500 - 2000 - 5000 = 22500元。
22500元在超过36000元至144000元的范围内，适用10%的税率，速算扣除数为2520元。
应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数
应纳税额 = 22500 × 10% - 2520 = 2250 - 2520 = -270元。
由于计算结果为负数，表示不需要缴纳个人所得税。
建议
了解专项附加扣除：
专项附加扣除包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金和赡养老人等，这些扣除项可以显著降低应纳税额。
咨询专业人士：由于税法可能会有变动，建议咨询专业的税务顾问或财务人员，以确保计算的准确性。
希望以上信息对你有所帮助。