管种地的部门主要是 自然资源部（原国土资源部）和地方政府。
自然资源部是国务院的组成部门，负责全国土地的统一管理工作。
该部门的主要职责包括拟订和贯彻、执行关于土地的法律、法规与方针、政策；主管全国土地的调查、统计、登记和发证工作；组织有关部门编制土地利用总体规划；管理全国土地征用和划拨工作，负责需要国务院批准的征、拨用地的审查、报批；调查研究，解决土地管理中的重大问题；对各地、各部门的土地利用情况进行检查、监督，并做好协调工作；会同有关部门解决土地纠纷，查处重大违法案件等。
县级以上地方人民政府土地管理部门主管本行政区域内的土地的统一管理工作。
乡镇人民政府负责本行政区域内的土地管理工作，一般设置土地管理所，负责具体土地管理工作。
农业部门负责农田的保护管理工作，包括农田的用途管制、农业经营能力、经营行为和土地流转合同的监管等。
农业部门与国土资源部门共同审核设施农用地，确保设施用地的合理性和合规性。
综上所述，管种地的部门包括自然资源部及其下属机构、地方政府及其土地管理部门、以及农业部门及其相关机构。具体职责和分工根据相关法律法规和政策进行明确。