根据2024年8月29日的数据，南通各区的房价如下：
启东市：新房均价14130元/㎡
通州区：新房均价16500元/㎡
开发区：新房均价19000元/㎡
崇川区：新房均价24533元/㎡
港闸区：新房均价19655元/㎡
中创区：新房均价29418元/㎡
从上述数据可以看出， 港闸区和 通州区的新房均价相对较低。具体来说，港闸区的新房均价为19655元/㎡，通州区的新房均价为16500元/㎡。因此，在这两个区域中， 通州区的房价更低一些。
建议您根据最新的市场情况和具体需求，进一步了解这两个区域的详细楼盘信息和优惠政策，以便做出更合适的选择。