办理抵押登记证的流程如下：
线上办理
进入山东省政务服务网（http://www.shandong.gov.cn/col/col94091/）。
在页面中找到山东不动产登记“一网通办”平台（试运行），点击进入。
登录页面，选择个人登录或法人登录，有账号的直接登录，没有账号的可以点击立即注册，根据流程注册账号并进行实名认证。
登录后选择济宁市曲阜市，点击确定进入服务平台首页。
在平台首页，选择“我要办理”，选择相对应的业务类型，录入个人信息，根据要求上传资料图片，提交申请。
通过预审后，等待审核完成，便可领取电子证照。
线下办理
申请人填写《市房产登记申请表》并提交材料（提交材料见办证须知）。
终审前申请人可撤回登记。
登记申请书；
申请人身份证明（包括抵押人，借款人，抵押权人）；
房屋所有权证书，土地使用权证；
抵押合同；
主债权合同；
其他必要材料。
初审：窗口收件人员收件出具收件清单，收取费用，审核登记材料，输入权属登记信息签署初审意见。如有必要还须进行现场查勘。
复审：复审人员按要求审核登记材料，核对电子数据并签署复审意见。不符合条件，退回，一次性告知补齐。不符合规定，出具不予登记、暂缓登记决定通知申请人（7日内）。
终审：终审人员按要求审核登记材料，核对电子数据并签署终审意见。终审后缮证前自动生成权证号码，生成登记薄。
制证人员按规定打印房屋权属证书和相关材料，移交至相关科室。
申请人或其代理人持收件收据至发证、收费窗口领取权属证书。
办理房屋抵押手续后，登记材料归档。
建议
提前准备：申请人应提前准备好所有必要的材料，确保材料的真实性和完整性。
选择渠道：可以根据个人习惯选择线上或线下办理，线上办理更加便捷，线下办理可能需要亲自跑动。
咨询确认：在办理过程中，如遇到不明确的地方，可以及时咨询相关部门或工作人员，确保流程顺利进行。