马来西亚第二家园计划的申请流程如下：
个人履历表（包括学术资格、工作经验、专业知识与技能）。
6张护照型彩照（3.5公分乘5公分、蓝色背景）。
护照复印件（含详情页面及所有出入境印章页面，必须公证）。
无犯罪记录推荐函（由原居住国相关政府机构签发）。
结婚证书（如果携带配偶）。
子女的相关文件（如出生证明、收养证明等）。
将所有准备好的材料递交给马来西亚移民局。
支付相应的申请费用。
递交申请后，大约需要三个月左右收到原则性的批复。
收到批复后六个月内需登陆马来西亚进行存款、体检等相关手续。
体检一周后，携带存款证明、体检报告、医保等文件前往移民厅递交。
递交所有必要文件后，一般一天之内可以收到第二家园签证。
批准后，需在马来西亚的银行存入一定金额的定期存款，具体金额根据年龄和随行家属人数而定。
存入的定期存款在一年后可以部分取出用于购房、医疗及子女教育等费用。
申请人需在大马居住满一定天数（如90天）。
申请过程中若有任何特殊情况，如需要提前取出存款，需获得马来西亚移民局的批准。
申请人可以随时放弃身份，并需通知移民局。
整个申请流程约为3-4个月，建议提前规划并准备好所有必需的文件。