离职时还有调休的情况下，用人单位应按照以下标准补偿未休完的休息日（即存休）：
用人单位需按照薪资标准的200%向劳动者支付相应的补休工资。
如果存休属于年休假的应休未休部分，用人单位应当依照法律规定，向劳动者支付三倍的工资报酬。
这些规定依据《劳动法》第四十四条，详细说明了在不同情况下用人单位应支付高于正常工作时间工资的情形，包括延长工作时间、休息日工作且不能安排补休、以及法定休假日工作。
因此，建议用人单位在处理离职员工的存休问题时，严格按照上述标准进行补偿，以符合法律规定并保障劳动者的权益。