运费拖欠后，权利人可以在 三年内向法院提起诉讼。具体依据如下：
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《中华人民共和国民法典》第五百七十七条规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
因此，建议权利人在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼，以维护自身合法权益。
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