低保户在住院费用报销时，可以选择以下几种途径：
携带身份证、户口本、低保证明等资料到当地社保中心的相关部门进行报销。
可以到民政局的低保科或社会救助科进行医疗救助报销。
在出院时，可以直接在医院的结算窗口进行报销。
在住院时提供身份证、低保证等相关证件，办理住院登记手续，出院时由医院根据新农合政策进行结算。
向当地乡镇人民政府（街道办事处）或县级民政部门提出医疗救助申请，并提供必要的材料进行审核和审批。
需要咨询当地民政部门或社保局了解具体的报销流程和材料准备。
请注意，具体的报销比例、范围和流程可能因地区和政策而异，建议提前咨询当地相关部门获取最新信息。需要准备的材料通常包括身份证复印件、户口本首页复印件、低保证复印件、申请表以及医院开具的药费分单等。